傳統的發酵液菌絲分離采用板框過濾或離心分離，但板框過濾、或離心分離勞動強度大，分離精度低，給后序工藝造成很大麻煩，而且產品品質不高，影響產品價格。另外，板框過濾或離心分離水洗量較大，后序工藝廢水量較大，給環保造成較大壓力。現在國內某些廠家采用菌絲，效果很好使用過濾水洗量小，后序工藝處理容易,廢水量小(國內某肌苷廠采用陶瓷膜過濾除菌絲，廢水排放總量減少40%)，產品品質高而且可以大幅度提高得率。并且陶瓷膜再生容易，清洗劑用量少且便宜，壽命長.陶瓷膜成套設備可以采用全自動化控制,勞動強度非常小。    主要成分：水88～89%、菌體～1%（凈重，體積濃度～5%）、賴氨酸10%和其它離子等；    物化性質：pH =2； ρ=1.1×103 kg/m3；μ=10 mPa*s；
    本流程主要包括：     主過濾回路。  主過濾回路包括主過濾、輔過濾兩部分，主過濾由發酵液進原料罐，經變頻供料泵、循環泵，進主過濾部分，濃液進濃液罐，清液進清液罐。輔過濾由濃液罐中濃液加洗水，經變頻供料泵、循環泵，進輔過濾部分，清汁進清液罐，濃液部分加3次洗水過濾后排放。     清洗回路。陶瓷膜經過一段時間運行后通量會有所下降，此時通過清洗來恢復通量。用排空泵將循環側、滲透側料打空。
    賴氨酸發酵液經過上述工藝處理后得到澄清的透出液，賴氨酸的收率可以達到98%以上。因此該工藝是分離賴氨酸發酵液中菌體的很好的方法。